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과제정보

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과제명 차세대 염기서열분석기(NGS) 분석용 식물 Universal marker set의 개발
기관명 대검찰청
담당부서 차장검사 과학수사기획관 과학수사담당관
전화번호 02-3480-3735
연구기간 2017-05-15 ~ 2017-12-20
연구분야 검찰활동
개요 법생물 혼합감정물에서 다양한 식물의 혼입 및 종식별의 정확성을 높이기 위해 다수의 NGS분석용 식물 DNA마커의 개발이 필요하며, NGS에 적용이 가능한 PCR 동시증폭(multiplex kit) 개발과 NGS 분석법 개발을 통해 신속?정확한 식별이 필요하기에 
1. 학술논문 및 문헌 검토를 통해 적용 대상 범용 마커 선정
2. 혼합 감정물에서 일반 식물의 종(속, 과)수준의 식별이 가능한 범용 DNA마커의 NGS 분석 가능 구간 선정 및 특수식물의 종 특이 식별 마커 적용
3. NGS용 식물 Universal marker의 동시증폭 검출법 개발
4. Multiplex marker set의 법생물 사례 적용 가능성 확인 및 실무 적용을 위한 매뉴얼 작성
이상의 내용으로 과제를 수행하여 건강기능식품에관한법률위반사건 및 원산지허위표시위반사건 관련 식물의 종식별 및 혼합비율 분석과 불법 및 마약성 식물원료 물질의 식별에 적용 예정

계약정보

과제정보
수행기관 서울대학교 산학협력단 [대학]
수행연구원 양태진
계약일자 2017-05-15
계약방식 제한경쟁입찰에 의한 계약
계약금액 50,000,000원

연구결과 정보

과제정보
제목 차세대 염기서열분석기(NGS) 분석용 식물 Universal marker set의 개발
연구보고서 비공개 공개제한 근거 5호 
비공개사유 5. 감사·감독·검사·시험·규제·입찰계약·기술개발·인사관리·의사결정과정 또는 내부검토과정에 있는 사항 등으로서 공개될 경우 업무의 공정한 수행이나 연구·개발에 현저한 지장을 초래한다고 인정할 만한 상당한 이유가 있는 정보

목차
1. 요약문
2. 연구개발의 필요성
3. 연구개발의 목표, 내용 및 결과
    3.1 연구개발 목표
    3.2 연구개발 내용
    3.3 연구개발 결과
4. 연구개발 결과의 활용방안 및 기대성과
5. 참고문헌
초록
본 연구에서는 알려진 대마, 양귀비, 대마 근연종, 인삼, 당귀 등의 엽록체 서열들 간의 비교 유전체 분석을 통해 이들 간에 매우 보존된 지역들을 대상으로 NGS 분석에 적합한 18개의 프라이머 후보를 제작하였다. 또한 기존에 알려진 바코딩 서열 데이터베이스를 이용할 수 있도록 엽록체 matK와 rbcL 지역에서 새로운 NGS용 universal primer 세트 4개를 제작하였다. 이들은 대마, 양귀비, 인삼 및 인삼 근연종, 당귀, 식방풍 등에서 안정적으로 증폭이 되는 것을 확인할 수 있었으며, Multiplex PCR 조건 최적화 과정을 통해 최대 3종류의 프라이머를 섞어 혼합 DNA에 적용하였을 때에도 PCR 증폭이 잘 되는 것을 확인하였다. 이들 프라이머들이 실제 NGS 상에서도 적용이 가능한지 살펴보기 위하여 단일 프라이머들을 단일 DNA 조건에서 1차 PCR을 진행하고 이들을 프라이머 별로 섞어 NGS 분석을 진행하였다. 생산된 서열을 필터링하고 NGS read들을 각 식물들의 Reference 서열에 다양한 조건으로 mapping하여 최적의 분석 조건 을 확립하였으며, mapping을 통해 계산된 각 시료들의 read depth가 초기 DNA 농도와 동일한 패턴을 보여주는 것을 알 수 있었다. 이를 통해 기 제작된 프라이머들이 종에 구분 없이 안정적으로 PCR 될 뿐 아니라, 실제 NGS 분석에도 충분히 적용이 가능함을 확인할 수 있었다.
주제어 차세대 염기서열분석기(NGS) 분석용 식물 Universal marker set의 개발
제작일 2017-12-13
발행년도 2017년

공공누리 정보

공공누리
저작물
민간이용 동의
동의안함
비동의 사유 과제 성과물에 대한 특허 등록을 위하여 2년 연속과제 완료 이후로 보고서 비공개 설정

연구결과 만족도

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