최근완료된 연구과제

Home  최근완료된 연구과제

과제정보

과제정보
과제명 한국인 참조에피유전체 정보생산(2018)
기관명 보건복지부
담당부서 질병관리본부 국립보건연구원 유전체센터 유전체연구과
전화번호 043-719-8896
연구기간 2018-03-20 ~ 2018-12-15
연구분야 생명과학연구지원
개요 - 만성질환자(당뇨 등)에서 분리한 원시세포에서 에피유전체연구를 위한 정보생산

- 원시세포에서 에피유전체 정보생산(6건 데이터세트)
  · 정보생산 대상 시료 확보(에피유전체 정보 공개가 가능한 기 확보 시료 또는 신규 수집 한국인 원시세포)
  · 확보된 세포를 대상으로 국제인간에피유전체컨소시엄(IHEC) 기준 참조에피유전체 데이터세트*를 생산함
    * 데이터세트의 구성: (1) WGBS, (2) RNA-seq, (3) Histone ChIP-seq 7종(H3K4me1, H3K4me3, H3K9me3, H3K27me3, H3K36me3, H3K9Ac, Input), (4) Small RNA-seq (5) Infinium HumanMethylation EPIC chip

 - 생산된 정보는 가공데이터*(데이터 공개를 위한 변환데이터)와 함께 제출
    * 가공데이터포맷: 국제컨소시엄(IHEC) 공개를 위한 bigBed, bigWig 파일 포맷 생성 및 metadata(JSON) 기록

계약정보

과제정보
수행기관 서울아산병원 [기타]
수행연구원 김송철
계약일자 2018-03-20
계약방식 일반경쟁입찰에 의한 계약
계약금액 300,000,000원

연구결과 정보

과제정보
제목 한국인 참조에피유전체 정보생산(2018)
연구보고서
목차
Ⅰ. 연구결과 요약문
 한국인 참조에피유전체 정보생산 (2018)
 Reference epigenome data production from Korean (2018)

Ⅱ. 정책연구용역사업 연구결과
  제1장 최종 목표
  제2장 국내외 기술 현황
  제3장 최종 정책연구용역사업 내용 및 방법
  제4장 최종 정책연구용역사업 결과
  제5장 연구결과 고찰 및 결론
  제6장 연구성과 및 활용계획
  제7장 정책연구용역사업 진행과정에서 수집한 해외과학기술정보
  제8장 기타 중요변경사항
  제9장 연구비 사용 내역
  제10장 참고문헌
  제11장 첨부서류
초록
● 인간게놈프로젝트를 기반으로 전장유전체분석연구를 수행하였으나 인간의 질병 전체를 설명, 예측 할 수 없는 부분을 보완하기 위하여 후성유전체프로젝트가 전 세계에서 독립적으로 실행되었고 이를 조직화하여 국제인간후성유전체콘소시엄(IHEC, International Human Epigenome Consortium)을 설립하였음
● IHEC는 2020년까지 세포 250 종 대상 1,000개 후성유전체지도를 확보하여 인간의 건강 및 질병에 핵심적으로 관여하는 메커니즘을 규명하고자 함 
● 한국의 질병관리본부(KNIH)는 IHEC과 공동연구를 추진하여 50종 인간 세포에 대한 참조후성유전체지도 작성을 목표로 하고 있음
● 본 연구용역과제에서는 제2형 당뇨병 환자, 당뇨정상인 환자의 췌장조직 내 췌도세포 3종, 비만, 비만정상인 환자의 지방조직 3종을 성체 조직에서 분리 후 IHEC에서 권고하는 기술과 프로토콜에 따라 아래와 같은 후성유전체 정보를 생산하였음
1) 6종 세포로부터 분리한 DNA를 이용하여 고해상도의 메틸롬 지도작성을 위한 WGBS 및 Human Methylation EPIC Bead Chip array 데이터를 생산함
2) 6종의 세포에 대해 각각 7종의 히스톤 마커(H3K4me1, H3K27ac, H3K4me3, H3K36me3, H3K27me3, H3K9me3, Input)에 대한 고해상도 지도 작성에 필요한 ChIP-seq 데이터를 생산함
3) 6종 세포에서 기능성 유전자의 발현조절부위에서의 후성유전 조절기전을 해석하기 위해 ChIP-seq 및 메틸롬 데이터와 통합 분석할 RNA-seq 데이터를 생산함
4) 6종 세포에서 non-coding RNA 및 small RNA 발현을 카탈로그화 할 수 있는 small RNA-seq 데이터를 생산함
● 각 절차는 필요한 sequencing 분석 도구를 이용하고, 각 절차는 trimming, mapping, output file conversion 등으로 진행되었으며, 생산된 데이터는 IHEC이 제시하는 데이터 포맷과 동일한 형태로 생산되었고, 보건원에서 제시한 기준에 부합하는 충분한 read 수를 상회함으로써 고품질의 데이터를 생산하였으며, 한편 데이터의 편향된 정도 등을 확인하는 품질관리 과정을 통해 각각의 데이터가 실험 목적에 부합하도록 생산하였는지 확인하였음
● 본 연구를 통하여 생산된 데이터는 당뇨병 및 비만의 만성질환 원인을 규명 할 수 있는 분석 기반이 되어 향후 만성질환을 극복할 수 있는 후성유전학적 연구 활성화에 기여할 것으로 기대하며, 또한 본 연구결과로부터 생산된 데이터를 IHEC에 제공함으로써 국가의 과학 기술과 정보 경쟁력에 기여할 것으로 기대됨
주제어 에피유전체학, 메틸화, 유전체정보, 만성질환, 당뇨
발행년도 2018년

연구결과 평가 및 활용보고서

과제정보
평가결과서
활용결과 보고서 ※ 등록되지 않았습니다. (영 제52조에 따라 연구 종료 후 6개월 이내 등록)

공공누리 정보

공공누리
저작물
민간이용 동의
동의안함
비동의 사유 진행중인 사업

연구결과 만족도

연구결과 만족도
참여인원 : 0명 점수: 0
연구결과 만족도 평가정보
조회된 정보가 없습니다.

만족도 평가

연구결과 만족도 평가정보
*비밀번호